结果江苏省考中之蒋雍植、钱大昕、吴烺、褚寅亮、吴志鸿；浙江省考中之谢墉、陈鸿宝、王又曾，均“赐举人，授为内阁中书学习行走，令其与考取候补人员一体补用”。乾隆用这样的办法，既选拔了一批人才，又优容和团结了江浙的文人学士。乾隆回程时绕道到江宁（南京）祭明太祖陵，谕令：“该督抚饬地方官加意保护，其附近陵地，毋许樵牧往来致滋践踏，并晓谕各陵户知之。”这对于笼络汉族士绅，巩固清朝的统治地位也是必要的。当时江宁丝织业很发达，乾隆与皇太后又亲临织造机房察看工匠织机。接着乾隆经山东至泰山岱庙焚香，于五月初四日返还北京圆明园。
第二次南巡，于乾隆二十二年农历正月十一日开始。乾隆渡黄河后阅视了天妃闸，乘船沿运河南下到达苏州，汉族经学家顾栋高“献所著诗书两义”，乾隆特赐以国子监祭酒，乾隆又谕令内阁：“三吴两浙，民多俊秀，加以百年教译，比户书声，应试之人日多，而入学者则有定数，其将江苏、安徽、浙江三省本年岁试文童，照乾隆十六年例，府学及州县大学增取五名，中学增取四名，小学增取三名”，以“乐育人才”。苏州著名诗人沈德潜“年逾八十，实为蓬瀛人瑞，今来接驾，著加恩给予礼部尚书衔”。苏州不仅是文化中心，也是手工业商业非常繁荣的江南经济重心，乾隆和皇太后又“临视（苏州）织造机房”。到达杭州后，乾隆又下谕令将浙江进献诗赋而考取一等的童凤三、陈文组、顾震、钱受谷，照乾隆十六年之例，“俱特赐举人，授为内阁中书学习行走，与考取候补人员一体补用”。
乾隆南巡时多次在江宁、京口（镇江）、杭州阅兵，目的是整饬军旅，振兴武备，炫耀武力。他希望清代保持以武功开国的传统，为巩固封建统治服务。在杭州时，他检阅了水师操练，接驾的汉族绿营兵丁有奏箫管细乐的，乾隆很不满意，加以申斥，认为“身隶行伍，当以骑射勇力为重，若吹竹弹丝，技近优伶，岂挽强行重之夫所宜相效”，“嗣后行伍中但许用钲鼓铜角，其箫管细乐一概行禁之”。在途中乾隆看到外省驻防将军及绿营之提镇外出都坐轿子，便传谕说：“将军提镇有总统官兵之责，若养尊处优自图安逸，亦何以表率营伍而作其勇敢之气？况旗人幼习骑射，即绿营中亦必以其弓马优娴，始历加升用。”命令以后将军、提镇一律骑马，不许坐轿，否则以违治例治罪，力图保持军队勇敢尚武的局面。
乾隆回程时又绕道去江宁祭明太祖陵，沿运河北上后，先后阅视洪泽湖及徐家集、荆山桥、韩家闸一带河工。当时黄河流经徐州地区，河身狭窄，两岸相距甚近，夏秋涨水，容易溃决。乾隆亲自到那里阅视河防，看到北面护城有石堤，东西皆土堤，便谕令对所有的石堤“应加帮以培其势”，无石堤之处“应按筑以重其防”，他下令徐州一带添筑的石堤用石十七层，极为坚固，蔚为壮观。苏北常年受水患，灾民甚多，在经过徐州附近的桃源、宿迁、邳州、睢宁诸州县时，乾隆看到灾民“鹑衣鹄面，相望于道”，决定立即给以赈济并蠲免赋税，并实行以工代赈，使灾民们有所工作，河防工程也得到了需要的劳动力。
这些措施乾隆认为“于穷黎有益，而于工程亦易集其事”。接着，乾隆沿陆路到曲阜祭奠孔林，四月二十六日回到圆明园。
第三次南巡，于1762年（乾隆二十七年）正月十二日开始。到达清江后，乾隆坐船巡视河堤，决定确立清口水志，地方官于夏秋大水时，按志开放，以保卫下游地区。以往洪泽湖水涨，河臣随意开坝，使下游居民常受其患。乾隆规定高家堰的五坝水志“上坝增一尺之水，下坝开十丈之门”，河臣遵守了这一规定，使较长一个时期下游各州县滨河地区免受水淹之患。当时黄河中河滩渐积，如遇大水，各处闸坝宣泄不畅，下游将受其害。乾隆谕令当徐州水志的水位高到一丈一尺五寸时，方准将毛城铺以东的唐家湾引河开放宣泄，水落即行关闭。乾隆又详细阅视了上次南巡时下令修建的武家墩以北砖堤，命将济运坝至运河的五百丈土堤也一律筑为砖堤，使其整齐坚固，他还特别谕令地方官要把砖块烧得宽厚、结实一些，保障洪泽湖堤工的安全。
过长江后，乾隆在焦山操阅水师，在苏州到文庙行礼。他尽量优容、团结、宠用汉族的文人学者，左都御史梅珏成过去曾和康熙一起研讨过数学，是当时闻名的老一辈数学家和三朝老臣，以年迈按原品在籍致休。这次，梅珏成来靖江铺接驾，乾隆亲自写诗：“推恩缘念旧，皇祖内廷臣”相赠，命将梅的长子赐举人出身以示恩宠。江浙著名诗人沈德潜、钱陈群至常州接驾，乾隆亲笔题诗相赠：“二老江浙之大老，新从九老会中回，身体康强自逢吉，芝兰气味还相陪。迎堤恭遇以为喜，出诗命和群应推，更与殷勤订清约，期颐定复登金台”，以示慰勉。在苏杭两地，乾隆按照上次的惯例，谕令内阁对进献诗文的汉族文人学者进行考试，择优录用。因进献诗赋考取一等之士孙士毅、吴泰来、陆锡熊、郭元釪，举人汪孟鋗，“俱着授为内阁中书，遇缺即补”；其他考中之文人沈初、王銮、程晋芳、赵文哲、严长明、徐步云、钱襄，“赐举人，授为内阁中书学习行走，与考取候补人员挨次补用”。
值得注意的是，乾隆为进献诗文者出的考试题目，并不是像八股文式的抽象玄虚与现实无关的题目，而是结合治政需要的务实的题目。例如：他这次到杭州的第二天即去海宁，住在康熙朝大学士陈元龙的别墅隅园（后来改名为“安澜园”）中，巡视、筹划和决定浙江省的海塘工程，便出了“海塘得失策”这一题。乾隆的意图是：通过评阅试卷，即可了解吸取汉族文人学者对如何治理海塘的积极意见，供自己采纳和参考；又可以从中发现和重用既文笔出众又具有治政卓见的优秀人才。这一办法确实是比较有远见的。浙江省获得第一等第一名的仁和县进士孙士毅，便在他的文章中提出了因地制宜的修治海塘的较切实可行的办法，因而受到乾隆的重视。
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