康熙八年（1669）五月的一天，鳌拜假称有病不去上朝，还放出风声，说皇帝应该到他家去探望。
康熙皇帝果然亲自来到了鳌拜家，刚走进鳌拜的卧室，见鳌拜神色十分紧张，双手按住床沿，一个御前卫士快步走上前去，揭开床席一看，原来下面藏着一把匕首。鳌拜见此情景十分紧张。康熙帝却出人意料地大笑道：“刀不离身是满人的故俗，不足为怪。”当场稳住了鳌拜。说罢，他详细地询问了鳌拜的病情，嘱咐他好好调养，又对左右侍候的人嘱咐了几句，起身回宫去了。
康熙做好了铲除鳌拜的各项准备工作。他以各种名义将鳌拜的党羽先后派出去，削弱了他的势力。将鳌拜的胞弟内大臣巴哈“差往审理察哈尔阿布奈之事”；将鳌拜亲侄侍卫苏尔马差往科尔沁，将鳌拜姻党理藩院左侍郎绰克托差往苏尼特编定扎萨克事务；将工部尚书都统济世差往福建“巡海”。一切安排就绪，康熙于8年（1669年）五月十六日，亲自给那些每天跟他摔跤的少年侍卫做动员部署。他问：“你们是怕我还是怕鳌拜？”侍卫们齐声说：“我们只怕皇上。”
康熙宣布了鳌拜的罪过，布置道：“等会儿鳌拜来了，你们看我的眼色行事。”
过了一会儿，鳌拜进来了，他像往日一样大摇大摆地走着，没等他站稳脚跟，康熙帝使了个眼色，那伙少年侍卫一哄而上，连拉带拽将他推倒在地。鳌拜本来是个身经百战、受过“巴图鲁”（满语“英雄”）封号的武将，开始以为是几个小孩子跟他闹着玩的，等他看清了小皇帝冷峻的面孔，才猛然醒悟过来，但这时已被捆住手脚不能动弹了。同时被抓的还有另一辅政大臣遏必隆和一等侍卫阿南达等人。
当下，康熙帝召来了议政王和大臣，命令他们审讯鳌拜。议政王和大臣们平日都痛恨鳌拜的专横，一桩桩列举了鳌拜欺君枉上等三十条罪行，一致要求将他处以死刑，其亲子、兄弟一并处斩，妻子和孙子为奴，家产籍没。其族人有官职以及在护军者，均应革退，各鞭一百，披甲当差。其他如遏必隆等一批亲信党羽分别判立绞、立斩、即行凌迟处死等。
议政王和众大臣议定上奏皇上。康熙帝再次召见鳌拜等，当面审问。五月二十五日，康熙帝在历数了鳌拜结党专权、紊乱朝政等诸罪行之后，宣布：“情罪俱真，本当依议处分，但念鳌拜累朝效力年久，且皇考曾经倚任，朕不忍加诛，姑从宽免死，革职籍没，仍行拘禁。遏必隆无结党之事，免其重罪，削去太师及后加公爵，其原有一等公，仍准留与伊子。”
擒拿鳌拜涉及权力更迭大事，人事关系十分复杂，但康熙帝仅用十天就全面宣布处理结果。从谕旨内容看，毫无报复之意，体现了极高的政策水平，做到了法外施仁，区别对待：鳌拜以功免死拘禁，其兄赵布太、子那摩佛也从宽免死拘禁；遏必隆免其重罪，数月之后又“特为宽宥，仍以公爵，宿卫内廷；罪不可赦的死党仅处死了9人，比原议大大减少；有的死党免罪还留原任；满汉文武官员中，因畏鳌拜权势趋炎附势者，均免以查处。康熙帝在铲除鳌拜集团时，表现了极其宽大仁政的胸怀，有效地防止株连，稳定了朝廷秩序。另外，凡受鳌拜迫害致死、革职、降级者，都一一给予平反昭雪。对已故苏克萨哈等，其爵位、世职，由其后人承袭。此案的处理深得人心，表明了年轻的康熙帝已日趋成熟。
议处鳌拜，废除了辅政大臣，康熙帝收回了批红大权。从此以后，各处奏折所批朱笔谕旨，全部出自皇帝之手，从不让人代书。即使康熙帝年老后，仍坚持这一习惯，右手患病不能写字，就用左手执笔批旨。
康熙帝认真反思和吸取了鳌拜事件的教训。坚决反对官员怀挟私仇互相陷害，从这以后的三四十年间，无大臣互相攻击之事发生。康熙皇帝鉴于过去议政王大臣会议被鳌拜把持，会议之事还未确定，外面的人就已知道了，为此进行了整顿，规定诸王、贝勒、大臣务须缜密，不得泄漏秘密。针对鳌拜专权时形成的“交通在内近侍，使令人员妄行干求，或潜为援引，或畏威趋奉”等官场歪风，康熙帝规定“仍前干求趋奉者，定行从重治罪，决不饶恕”。
16岁的康熙皇帝机智果敢地铲除了鳌拜集团，摆脱了当傀儡的烦恼，真正达到了亲政的目的，从此他兢兢业业勤于朝政。御门听政是康熙帝接见臣下、处理日常政务的主要形式。他除了每月的初五、十五、二十五日在太和殿上朝外，其余时间都去乾清门听政。
康熙帝御门听政风雨不误，做到每天“未明求衣，辨色视朝”，春夏早晨六时、秋冬早晨七时，必须亲御乾清门听理朝政，从不肯懈怠。
康熙皇帝通过御门听政，对辅政时期的政治作了重大改进，及时了解下情，直接处理并不断改进政务。
康熙帝听政十分认真，坚持一一全览各部院呈送的本章。有的人以为皇帝未必能通览所有的本章，因此书写经常疏忽，康熙帝一一通览，连其中的错字都能发现并改了出来。遇有战事时，每天本章多达三四百件，通常每天也不下四五十件。不论多少，康熙帝都“亲览无遗”。康熙帝通过御门听政，充分发挥群臣的智慧，集思广益，使国事决策尽量避免偏颇失当。政务处理迅速及时，成为康熙朝政务的一大特点。
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