§加入光复会
到6月19日前后，秋瑾连续接到胞兄誉章的两封来信后给了兄长复信。之前的3月份，誉章接到妹妹从东京发来的信，说自己尽量合理安排微薄的生活费坚持学习，信中还提到在实践女学校宿舍的生活情况。还说“妹近在学校，身体甚耐劳，日习体操，能使身躯壮健。每月费用则限止若干，不多用一钱，惟买书参考须多用钱耳。”
知道妹妹的情况后，为了让妹妹坚持学习，誉章想尽办法筹措到一些资金，托住在北京的王子芳寄给秋瑾。当时，誉章不知道秋瑾和子芳的关系发展到什么程度，觉得自己不好过多插手他们的生活。结果，子芳并没有把钱寄给秋瑾。或许子芳认为控制生活费可以促使秋瑾早日回国。知道子芳没有寄钱后，秋瑾非常愤怒。认为子芳辜负了哥哥对自己的情谊，自己在东京省吃俭用，过着艰苦的生活，多么需要哥哥寄钱帮助自己呀。在给哥哥的信中，秋瑾愤怒地骂子芳说：“子芳之人，行为禽兽不若，人之无良，莫此为甚！”还说，今后，不使用王家的姓氏。可是，要想再去东京，这次回国必须筹措到钱，没有办法，秋瑾只好去求老母亲。母亲典当了家中所有值钱的东西，凑了600元钱交给女儿。对女儿说：“快些回来，安心过日子”，秋瑾流着眼泪感谢母亲。带着徐锡麟写给陶成章的介绍自己加入光复会的推荐函，以及徐锡麟催促陶成章尽快回绍兴，商定革命计划。6月28日，秋瑾离开绍兴，经过杭州赴上海。
秋瑾在上海逗留了半个月左右，在月刊《女子世界》第二年第一号上公开发表了《致湖南第一女学堂书》，提出“自立、就学、团结”的口号，指出“强国”是女性追求自身解放的最终目的，并且，再次号召女性到日本留学。
在上海，秋瑾恰巧碰到刚从日本回国的陶成章，把徐锡麟托带的信和推荐函交给他，虽然名誉上的会长蔡元培没有同意秋瑾加入光复会，由于有了实力派陶成章和徐锡麟的推荐，秋瑾终于实现了加入组织的愿望。在上海某地举行的入会仪式上，秋瑾宣誓道：“光复汉族，还我山河；以身许国，功成身退。”盖上血指印后，秋瑾正式成为光复会会员。此后，陶成章介绍秋瑾认识了浙江会党首领丁鑅和吕熊祥等人，两年后，为了组织革命军，秋瑾不辞劳苦，反复往来于这些会党之间，作了大量的动员准备工作。
七月上旬，秋瑾在上海读到女诗人杨庄的五言诗《上海旅舍作》，深受感动，杨庄出身于湖南湘潭，嫁给湖南国学大师王闿运的四子王代懿，是一位著名的诗人，她的哥哥杨度曾经在弘文学院和嘉纳治五郎辩论。
17日，秋瑾乘坐班轮再次去日本，三等舱在船的底部，低矮的屋顶上悬挂着昏暗的灯泡，从通风口吹进丝丝凉风，满舱的旅客就依靠这仅有的新鲜空气，在闷热难耐的船舱里忍受着酷暑的煎熬。涂抹着白色油漆的舱顶和支柱，以及墙壁都散发着鱼油的腥臭，浑浊的空气使得晕船的人数在不断增加。秋瑾本来就很疲劳，这一段时间总感觉心脏不舒服，此时，秋瑾感到胸闷憋气，急忙来到甲板上一边深呼吸，一边眺望着远方的地平线。船沿着黄海和南海向东北方向前进，1894年9月17日，在这一带海域，日本联合舰队全歼清朝北洋舰队，提督丁汝昌吞食大量鸦片自杀，翌年，签订中日《马关条约》割让台湾，赔偿日本两亿两白银，中国国家主权沦陷于列强之手。去年8月，还是在黄海，日本联合舰队击溃了从旅顺港逃出来的俄国舰队。
日本夺取了清朝从属国朝鲜及俄国还有中国东三省的铁路经营权。
“国耻！”
秋瑾站在甲板上眺望着大海，心潮澎湃。对于外国列强一次次侵略和掠夺，清朝政府束手无策，不惜付出巨大代价乞求和平，使人民陷入深重的灾难之中，秋瑾痛恨腐败无能的清政府，她坐在长椅上赋诗两首，抒发自己的情怀。
之后，秋瑾以《黄海舟中感怀》为题发表了这两首诗，从如下两句中完全能使人感受到秋瑾愤懑的心情。
领海无权悲索漠 磨刀有日快恩仇
经过六天的航程，7月23日，秋瑾乘坐的船终于抵达东京，秋瑾决定还住在本乡元町元日馆自己从前居住的地方，办完实践女学校师范科的入学手续后，船中的暑热和过度疲劳使秋瑾昏倒在宿舍里，嘴唇干裂渗血，发不出声音，脸色苍白，呼吸困难，她挣扎着想站起来，同宿舍的人看到秋瑾身体不适，急忙照顾她躺下，一边拿凉毛巾敷在她的额头上，一边跑出去买药。
8月4日，还在卧床休息的秋瑾想起子芳对待自己的态度，不禁怒从心起，提笔给哥哥写信，信中斥责子芳道：“无礼实甚，天良丧尽”，“妹已衔之刺骨，当以仇敌相见”。同时还劝诫大哥“父母既误妹，我兄嫂切不可再误侄女”。表现出秋瑾对封建制度下父母包办婚姻的憎恨。也反映出秋瑾一旦认定的事情很难改变的性格。信的末尾，还提到自己在东京的打算。两个星期后，实践女学校普通课程停课放暑假，速成工艺师范科开始上课。
目前保留的明治三十八年（1905年）八月五日《实践女学校清国留学生分校日记》中记载：“今日，学生秋瑾入学。”
当时，担任中国留学生宿舍监督并负责指导留学生生活的坂寄美都子记录下了有关情况。
“秋瑾一人申请入学，从一开始就由我指导她的生活，所以和她非常熟悉，她给我看了一幅她在北京时女扮男装的照片，乍一看还真没认出来是谁，她是想试试我的眼力。她还说，自己在骏河台有300名支持者，在上海有500名支持者。秋瑾品行端正，严格遵守学校规则，除了平时访问亲友之外，没有任何可疑的行为。她说话简洁易懂，有时喜欢大声吟诗。”
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