这时，群臣们已经知道，袁绍为此事和董卓顶撞之后，已在侍卫队保护下即日出城，将司隶校尉印系于上东门城上，率领直隶禁卫军团，奔往原根据地冀州寻求保护。其弟袁术得消息后，也连夜率领本部，返回了故乡寿春，司隶军区部队及其原来勤王的外藩军团，当天之中便离去了一大半。
连袁氏兄弟都不敢抗衡，唯有躲避，群臣还敢说什么？一个个皆闭口不言。
董卓更举剑大声表示：“吾意已决，有敢表示反对者，以军法绳之。”
这时，那位生得高大雄伟的卢植站了起来，再度扯起大嗓门说：“古时候，太甲刚即位时做事便糊里糊涂的。昌邑王罪过千余条，才有所谓废立之事。当今皇上年纪尚轻，并无失德之事，是不能引用太甲及昌邑王的故事的。”
董卓听了大怒，拔出剑来要斩卢植。侍中蔡邕忙把董卓拦住，劝他别这样过激，要能容得人才行。董卓对蔡邕颇为喜欢，就收了剑，宣布暂缓处罪，但是将他革了职，看管起来。
议郎彭伯也私下劝阻董卓说：“卢植尚书是海内大儒，拥有崇高声望，若害之，恐天下震动，更不利于朝廷的稳定。不如赦免了他，不正可以表示你司空的宽宏度量吗？这对朝廷声望的提升也有实际帮助的。”
董卓便放了庐植，但令他从即日起退隐，从此不得再过问天下大事。
卢植被放出后，还怕董卓派人暗杀他，就急急忙忙地绕道逃到本乡，从此不再出头露面了。
去了卢植，反对的势力几乎完全排除。董卓便将废立皇帝的议案写下来，派人去交给太傅袁隗，向他征求意见。袁隗也只得提送群臣议决。
隔日，董卓再度召集群臣在崇德前殿，正式威胁何太后，废除少帝。
其议文如下：“先皇在丧，无人子之心，威仪不类人君，今废为弘农王，立陈留王协为帝。”
于是，逼着何太后下道诏书，立陈留王刘协为帝，就是汉献帝；少帝刘辩退位，改封为弘农王。
袁隗低垂着头，去解少帝玺绶，以奉陈留王。少帝脸色煞白，袁隗十分尴尬，含悲不敢言。
这时候，董卓早安排的人出面向献帝检举何太后迫害董太皇太后的罪行，将何进所为，一并嫁祸于她。献帝岂敢违反董卓之意，乃下诏，言何太后有逆妇姑之礼，着迁永安宫，加以软禁。
是日，改昭宁元年为永汉元年，这正是公元一八九年。
三日后，董卓派人给何太后送去一杯毒酒，正在永安宫哭得死去活来的何太后巴不得快点死，便一口将毒酒喝下去了。
又一日，董卓派人将舞阳君杀害。至此，何进一族全被诛灭。
十一月，董卓自立为相国，他指使亲信向皇上请求，给予他上朝时候三种特权：一、上朝可以不快步走；二、拜见皇上可以不报自己名字；三、上朝的时候，可以不摘下宝剑，不脱鞋子。
皇上当然不能不照准，因为董卓指使亲信请求皇上，不过图个形式而已。于是，董卓在朝中摆出一副僭越的样子，无视皇上与群臣。大家只有暗中叫苦，连劝阻的胆量也没有。
由于全国各地州郡没有拥护洛阳新政权的表示，董卓也深感不安。当时周毖及城门校尉伍琼，建议以官衔安抚反对派人士。董卓采纳了这个意见，便任用颖川人韩馥为冀州刺史，东莱人刘岱为兖州刺史，陈留人孔伷为豫州刺史，东平寿人张邈为陈留太守，颖川人张启为南阳太守。
这些人都不是董卓的亲戚、朋友，也不是原来的部下，就因为他们都有些名望，特地大胆使用，好让人家知道董相国任人唯贤，大公无私。
只有对于豪门大族的头头袁绍及袁术哥儿俩，他是很不放心的。但周毖和伍琼劝他以恩德去跟他们结交，让他们都做大官，就不会过不去了。他们对董卓说：
“袁家四世三公，不但名望大，还得人心。这一家的门生和官吏遍天下。如果不笼络他们，让袁绍、袁术去招集一批有势力的人来反对你，那恐怕山东不是你能保得住的了。还不如免了他们的罪，让他们也做郡守。他们免了罪，当然就高兴了，就不至于再生祸患了。”
董卓想了想也有道理，就拜袁绍为渤海大守，拜袁术为后将军留在京师里。
董卓的亲信，完全不给予显职，只充当将校里的军职而已。
袁术留在京师里怕遭董卓的毒手，扔了后将军的地位，守在南阳不动。
董卓不是外戚，也不是宦官，也不是儒生，也不是豪门望族。这些都不假。他是西凉的土霸，完全保持着强盗的气派。他听了别人的话选用儒生、名士，可是他根本不知道怎样和这些人打交道。但是他对自己的将士和前后归附他的士兵儿郎们却有高招让他们高兴。他不仅默许，甚至有时纵容他们去抢美女和财物。当时的京师洛阳是个最繁华的大城，里面住着皇亲国戚、贵族豪富。一条街接着一条街全是阔老爷们的“高楼大厦”。家家户户有的是金银财宝。董卓的将士们一进去，要妇女有妇女，要财宝有财宝。
军士们以检查户口，维护治安的名义闯进人家户里，大肆抢劫、强奸。
将士们抢劫回来的东西和美女，由董卓验收。董卓拣看得上的留下一部分，其余都归将士们。将士们无不高兴，都夸董相国够义气。
董卓听说何太后跟汉灵帝葬在一起，大坟里有许多奇珍异宝。就说：“珍宝埋在地下多可惜啊，不如拿出来用。”就令士兵们去刨开大坟，将珍宝悉数拿走。
更有甚者，董卓有时公然在皇宫里过夜，任意和那些美丽的宫女和公主们睡觉。宫里没有谁敢说个“不”字。
有一天，董卓带军队出城，到了阳城地带，正赶上那儿庙会，但见男男女女，热闹非凡。董卓心血来潮，灵机一动，便下令把赶庙会的人一概拿下，将男的杀了，砍下脑袋，挂在战车两旁；将女的没收为奴婢，装回城去。
董卓一行人浩浩荡荡开回京师，声言是杀敌回朝，大获全胜。
洛阳经过这次大变故，原先拥有军权的将领，死的死，逃的逃。即使司隶区原有的驻扎部队，不是向董卓集团投诚，便是逃离司隶区。因此，除了董卓自己的亲信外，实在已没有人可以负责洛阳城的军政工作了。但是为了提高新政权的声望，也为了争取更多的支持，这位新任的洛阳军政头子，必须是个深得人望的少壮派将领。
董卓和几位大臣反复商议和交换意见后，找到了一个公认唯一适当人选，这就是原任典军校殿尉的曹操。
当董卓的西凉军团进入洛阳时，曹操正指挥他的部队在宫中重整残破的宫殿及墙垣，并一一收敛遍地的尸体。他心事沉重，脸色发青，这一场亲眼目睹的动乱和残杀真使他难以忍受。他常自发问，作为人的基本良知，为什么在当权者的身上就丧失殆尽？邪恶者固然当惩，但无辜者为什么大量受株连呢？特别是那些还小小年纪的宦官，他们终日除了苦作和侍奉之外，连休息都不够，怎么会参与什么“阴谋”呢？他们或许连什么叫阴谋也不懂。但是，他们仍然逃不脱被惨杀的命运。也许他们在乡下的穷困父母，还盼望着有一天他们当宦官的儿子，会给他们带回去一点什么希望和福音呢！
确实，曹操在这一点上是受了祖父曹腾的影响。是祖父告诉他，小宦官们的家世都是很苦的。有钱人家，谁愿送孩子入宫当阉童呢？曹操正是从这一点上同情那些小黄门的。所以，那些反宦官派的人物，曾指责曹操同情宦官不是没有一点道理。但是，他们笼统地说曹操同情宦官却不对，曹操并不同情那些擅权作恶的宦官，相反，对他们恨得很；曹操是同情无辜的宦官，特别是这些刚来的小黄门。
而现在，不管有罪还是无辜，都一概惨死，他怎能不为此而哀叹呢？并为屠杀者不分青红皂白的举动感到惋惜。
更严重的还是，随着这场流血政变的发生，董卓的西凉军乘机入京，并在京城耀武扬威，纵容军士作乱，不能不令人感到更大的担忧。
曹操虽然并不认识董卓，但他深知处在眼前的乱局，任何外藩军团的进入，对朝廷都是严重的威胁，一旦处理不善，便可能会酿成内战。
果然不久，便发生了少帝被罢，丁原遇害及袁绍亡命的事件，曹操知道祸事迟早一定会降到自己头上来，便不得不考虑自己该如何办了。
根据他的分析，目前董卓的势力是很强大的，还无人与之抗衡，丁原一死，吕布倒戈，董卓几乎独霸天下。在相当长时期内，洛阳都不会安宁。作为一个朝廷将领，曹操无论如何也回避不了与董卓的关系，粗野而霸道的董卓又焉能容忍曹操做人的准则？一旦双方接触，必会碰出火花，任何一点火星都可能点燃祸火。他显然是不能在洛阳久呆的，只是还没有决定什么时候离开这儿。
但是，他得作好充分准备，以免事到临头措手不及。
首先，曹操要求父亲曹嵩离开京城洛阳。他对父亲说：“离开洛阳是为了避祸越快离开越好。”
但曹嵩放不下京城内的庞大家产，表示必须变卖整理后才能离开。
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