1949年春，国民党彻底失败的大局已定，上海的解放也只是时间问题。在这种情况下，潘汉年通过中共地下党的关系，向黄金荣传递信息，劝他不要跟国民党逃跑，只要遵守人民政府的一切政策法令，人民政府就不会为难他。黄金荣听从劝告，决定留沪不走。他悄悄命人将黄家花园“四教厅”内蒋介石亲笔题写的“文行忠信”匾额摘下砸碎，以表示不再追随蒋介石反共。不仅如此，为了表示自己将功赎罪，他还请人写出了一份国民党财产的报告和400多名青洪帮头目的名单清册，交给了中共上海地下党。他还多次告诫门徒不要参与国民党逃跑前进行的大破坏、大屠杀活动，对共产党能掩护就掩护，能支持就支持，为自己留条后路。
上海解放后，由于黄门中人多品杂，他的一些徒子徒孙仍不断地干坏事，这就势必涉及到黄金荣本身。对此，党内干部产生了不同看法。有人认为，打蛇要打头，不镇压黄金荣，无法镇压他的徒子徒孙；也有人认为，国民党反动派的死硬分子都跑了，杜月笙也跑了，黄金荣能够留下来还是好的。两种意见争论不休。对此，潘汉年在市府的工作会议上分析说，黄金荣是反动统治时期帝国主义的走狗，他的门徒在上海干了许多坏事，但是，上海解放后，他没有逃走，也就是说他对祖国还有感情，对我们至少不抱有敌意。
他声称不问外事，那很好，我们不必要把“专政对象”加在他头上，只要他表示态度就行了。这些话传到黄金荣那里，他从心底里佩服共产党人的气量和胸怀，感激人民政府对他的宽大。在统一思想的基础上，市人民政府还以实际行动落实对黄金荣的有关政策，如允许他照常经营“大世界”、“共舞台”等，但要他坦白交代过去所做的坏事。考虑他已80高龄，让他在身体条件许可的情况下，到“大世界”门口去扫扫马路，作为对他的一种改造。对此，当时沪上各报还刊登了黄金荣扫街时的照片，一时传为美谈。
为了表示对自己过去的悔过和对人民政府的拥护，黄金荣在1950年买了5万元的公债，以实际行动支援国家的经济建设。黄在上海是有不少财产的。但解放后，他的一个儿媳妇李志清席卷了黄的金银财宝逃往香港，这样他就剩下了有限的不动产。加之手头上也没有这么多现金，于是黄先后三次派人去香港找杜月笙帮忙，并打电报、挂长途电话向李志清要钱。最后，杜月笙让万墨林给黄汇去了5万元。1951年5月20日，黄金荣在《文汇报》上发表了长达千余字的自白悔过书，对自己的经历和罪过作了简单的叙述，特别是对1927年组织共进会，在“四·一二”大屠杀中充当蒋介石帮凶这件“历史上的大罪恶”，表示了“无限的悔恨”；对共产党和人民政府彻底改变旧上海的历史功绩，表示了由衷的敬佩；对政府的一切政策法令，表示“一定切实遵行”，并号召他的门徒们要主动地立即向政府自首坦白，“洗清各人自己历史上污点”，“争取宽大处理，重新做人”。黄金荣的《自白书》，对于当时正在进行的镇压反革命运动，起了有益的配合作用。
1953年，黄金荣又叫他的亲信龚天健写了第二份自白书，送交上海市人民政府，再一次表示了自己主动交待问题的态度和立功赎罪的决心。这一年6月20日，黄金荣因忽然发热病倒，不治身亡。黄去世后，潘汉年又协助陈毅妥善地处理了黄家的遗产问题，体现和维护了党的政策的连续性。当然，潘汉年在主管、指导上海市公安政法工作中，不是光靠政策和策略的感召力，来达到分化瓦解敌对势力，争取为我所用的目的，这仅仅只是潘汉年工作的一个方面。另一方面则是实行严厉打击、坚决镇压的方针。
这在潘汉年的指导思想上一直是明确无疑的。当时，上海市公安政法工作所执行的方针政策是：首恶必办，胁从不问，立功受奖。对于那些破坏革命，严重危害社会和人民利益的反革命分子，该杀的杀，该捕的捕，严惩不贷；对于潜伏下来的和派遣进来的特务分子，凡拒不自首的，一经发现，都采取了严厉的打击措施。例如前面提到的刘全德，一经逮捕便立即审判处以死刑。对于那些罪大恶极，不杀不足以平民愤的恶霸分子和杀人凶手，决不心慈手软，而是予以严厉镇压。例如人称“沪西半爿天”的恶霸柏文龙、江南“四霸天”之一的惯匪陆杏生、“杀人魔王”封企曾、“江北大亨”顾竹轩等，都经潘汉年亲自过问，报送上级执法机关最后审批，把他们推上了断头台。
就这样，潘汉年在上海解放初的日日夜夜里，在肃清敌特、反革命分子和根治黑社会恶势力的斗争中，费了巨大的心力。他和他所主管的上海市公安政法工作部门始终坚持了镇压与宽大相结合的方针，严厉地打击了反革命的嚣张气焰，巩固了新生的人民政权，成绩卓著，人民拍手称快。章士钊先生在致陈毅和潘汉年的信中用“宽猛相济，彪炳盖世”之词，高度地评价了上海的社会治理工作，虽近乎溢美，但并非太过。
在上海社会的治理过程中，取缔十里洋场烟、赌、娼，净化社会环境的任务也很繁重。如果说，取缔烟馆、赌场还比较容易的话，那么取缔妓院就比较复杂和棘手了。因为这直接关系到大批妓女的善后问题。据国民党警察局统计，旧上海登记注册的妓院就有800多家，妓女有5000多人。另外，还有1200多家妓院未经登记注册，被称之为“野鸡”的私娼有两万多人。
为了彻底铲除这一丑恶的社会现象，上海市人民政府进行了一系列的准备工作，研究改造妓女的措施，并采取逐步取缔妓院、收容妓女的方法，彻底加以解决。潘汉年是这一工作的主要策划者。他多次强调：对于妓院要分析。妓院的老板、老鸨是剥削者，以吸妓女的血液为生，他们往往是流氓分子和残酷剥削妓女的吸血鬼，对于这些人，必须坚决予以制裁。而妓女大都是农村和城市贫民在饥寒交迫中被骗、被抢、被贩卖来的，是被侮辱、被迫害的人，但她们进入社会的黑暗圈子以后，受到恶劣环境的影响，沾染了严重的不良习气。因此，必须以强制劳动和耐心的教育来改造她们。根据这一指示，市民政局成立了上海市妇女教养所，由市妇联选派干部，密切配合，专门收容妓女进行教育改造，同时为她们治疗疾病。从此，数以千计的妓女跳出了火坑，开始走上了自食其力的新生之路。颇有名气的上海四马路（今福州路）妓院中心，也在这个世界上永远消失了。这确是一件震惊世界的创举。
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