李斌良意识到此案的复杂性和危险性，加强了保密工作，迅速带吴志深等可靠同志赶到季小龙母亲家，却发现其家刚刚被一场大火焚毁，季小龙的母亲弟弟也都死去，可是，经尸检却发现两人心窝皆中了一刀，显然，不是死于火灾，而是杀人灭口，是活着的杀手季小龙所为。李斌良经深入调查，终于得知，季小龙有一个孪生哥哥，在出生不久就送给别人，再查其人，得知其名叫朱贵，因身患绝症外出看病死了。李斌良终于明白，当年被枪毙的就是这个人。通过种种迹象判断，季小龙藏身于外地，林平安可能是因为认出了他而被害。进一步调查，李斌良初步掌握，现任刑侦副局长和胡学正涉嫌参与了质换季小龙的罪恶活动，但，对他们为什么这么干却一时搞不清楚。
案情特别重大，李斌良感到自己无论如何难以独立继续承担下去，可是又不知相信谁才好，只好给地委赵书记打电话，赵书记告诉他，可以信任公安局长蔡明臣。经与蔡局长交换意见，李斌良才知道他早在秘密关注此案，并采取了必要的措施。其他一些有正义感的局领导也在此时站了出来。
这时，杀手及背后的罪犯们也意识到了危险，意识到李斌良是他们最大的威胁，决定由杀手来除掉他。就在这时，市委党委会通过了李斌良任刑警大队长的任命，并把宁静的丈夫余一平派到公安局来任副政委。可是，余一平是一个道德败坏的人，到任第一天晚上就出去嫖娼，在回家的路上遇到了杀手，因而失踪。接着，宁静家中出了事，有人开门进入她家，虽没丢什么东西，屋子却被翻得一沓糊涂。宁静提供，余一平一个非常秘密的小本子不见了。
这时，市长魏民又来到公安局，批示要全力侦破余一平失踪案。但，此时李斌良及蔡局长都已经识破其真面目，因为，他当年曾是公安局长，也当过法院院长，其人品老公安都知道，只是因为善于钻营爬了上去。种种迹象显示，他是质换季小龙的主谋。此来又是干扰破案，转移侦查视线，因此不为所动。
杀手按照幕后指使者的命令，开始执行杀害李斌良的任务，但没有成功，却暴露了自己。公安局开始全城大搜捕，终于在县招待所发现了季小龙住过的踪迹，但其人已经不知去向。这时，老队长病重死亡，临死前用微型录音机留言给李斌良，揭开了案件的内幕。果然如分析的那样，魏民是当年质换季小龙的主谋，秦荣积极参与，并因此被提拔为副局长。另一边，宁静家又出了事，她发现了余一平留下来的部分日记，从中发现，原来当年父亲的车祸也是魏民策划的，而凶手也可能是季小龙。由此，李斌良彻底明白了，季小龙曾经替魏民除去自己仕途上的绊脚石，所以，他必须救他，否则，他会供出他。质换成功后，季小龙自然继续成为他除去政治对手的工具。
一切真相大白，李斌良油然想起，目前本市空缺市委书记，传闻地委要从魏民和刘新峰二人中选择一人担任，而今天早晨刘新峰刚刚去省里开会，而本市又哪里也找不到季小龙，他能不能又奉命去杀害刘新峰？李斌良带吴志深等人迅速赶往省城保护刘新峰，就在杀手要实施犯罪时，李斌良及时赶到，与省公安厅的同伴们一起，同杀手及铁昆一伙黑恶势力成员展开了一场殊死搏斗。想不到，这时候变生肘腋，吴志深突然站到杀手一边向李斌良发难。原来，他是隐藏最深的内奸……
最后，经过激烈斗争，罪犯得到了应有的下场，可是，宁静等几名公安民警却英勇献身，给李斌良心灵中留下了永久的创伤。
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